Afin d’arrêter les nouvelles attaques de Mercurymon contre le monde humain, DATS autorise Yoshino, Thoma et Masaru à être envoyés dans le Digimonde. Malheureusement, leur présence ne passe pas inaperçue auprès du Digimon ennemi et d’une ombre mystérieuse, qui leur tend rapidement une embuscade après leur arrivée.