Doraemon a une peur bleue des rats, tandis que la maman de Nobita ne supporte pas les cafards. Doraemon donne à Nobita une flûte capable d’hypnotiser ses victimes et de les conduire sur la colline derrière l’école. Cependant, Nobita découvre qu’il peut gagner de l’argent en jouant le rôle du joueur de flûte d’Hamelin, en aidant les gens à se débarrasser des choses qu’ils n’aiment pas ou ne veulent plus.