Un mystérieux portail apparaît dans le district de Ginza, à Tokyo, où s’engouffrent diverses créatures attaquant les passants sans discernement. Yôji Itami, un réserviste des forces d’auto-défense est élevé en héros national pour avoir secouru bon nombre de civils. Désormais à la tête d’un bataillon d’exploration, il est mandaté pour explorer le monde au-delà de la porte.